空氣中的大腸桿菌、沙門氏菌會導致食品污染，一粒塵埃便可毀掉電腦芯片，因此，凈化車間已如家用空氣凈化器般普遍，企業利用凈化車間有效降低空氣中的灰塵、細菌、病毒等，并實現恒溫恒壓恒噪，提供良好的生產環境。其中，10萬級凈化車間標準更為普遍，生產過程中，須對車間進行動態實時監控，保證達到10萬級凈化標準。
測定潔凈度是否達標，須從多方面入手，有室內送風量、系統總新風量、靜壓差、截面平均風速、截面風速不平均度、空氣潔凈度等級、浮游菌和沉降菌、室內溫度和相對濕度、室內噪聲級等，以某個飲料車間的檢測為例說明。食品企業監測的主要潔凈標準是沉降菌和浮游菌的數量，這二者對食品生產的影響比較大。該飲料食品車間采用了沉降菌測定法：
沉降菌指落在地面或物體表面的灰塵中攜帶的細菌。在無菌操作臺開啟的狀態下，取內徑90毫米的無菌培養皿若干，無菌操作分別注入融化并冷卻至45℃的營養瓊脂培養基越15毫升，倒置于30-35℃培養箱培養48小時，證明無菌后備用。
將已鋪有營養瓊脂培養基的培養皿放在指定區域距地面約1米的規定處(一般每10平方米放置一個平皿)，在空氣中暴露30分鐘，采集沉降菌，改好平皿蓋兒，置30-35℃培養箱內培養48小時，取出計數，車間內應為操作狀態。檢測沉降菌數量，每碟小于或等于10個，便是合格的10萬級生產區。
一般來說，沉降菌法監測每月一次便可。凈化車間常用的儀器有溫濕度表、溫濕度計、數顯風速儀、紅外溫度計、壓差計、多功能聲級計、粒子計數器、風量儀等，它們是常規的實時檢測設備。
凈化車間不斷需要不斷的監測，還有嚴格的使用規范，高質量的凈化車間工程是不可或缺的，使得凈化空間有安全、節能、人性化等諸多優勢，更好的運行，創造一個良好的生活和工作環境。
